MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methylomicrobium alcaliphilum chromosome

Total Repeats: 73443

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016112	GAT	3	9	263564	263572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403622
4002	NC_016112	GTT	2	6	263583	263588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403622
4003	NC_016112	AG	3	6	263634	263639	50 %	0 %	50 %	0 %	357403622
4004	NC_016112	T	7	7	263646	263652	0 %	100 %	0 %	0 %	357403622
4005	NC_016112	T	6	6	263661	263666	0 %	100 %	0 %	0 %	357403622
4006	NC_016112	CTA	2	6	263766	263771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403622
4007	NC_016112	G	6	6	263797	263802	0 %	0 %	100 %	0 %	357403622
4008	NC_016112	CGAC	2	8	263830	263837	25 %	0 %	25 %	50 %	357403622
4009	NC_016112	TTC	2	6	263889	263894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403622
4010	NC_016112	CG	3	6	263933	263938	0 %	0 %	50 %	50 %	357403622
4011	NC_016112	CGA	2	6	263942	263947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403622
4012	NC_016112	GGC	2	6	264150	264155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403623
4013	NC_016112	TTC	2	6	264165	264170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403623
4014	NC_016112	AAT	2	6	264197	264202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403623
4015	NC_016112	GAC	2	6	264261	264266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403623
4016	NC_016112	TGA	2	6	264344	264349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403623
4017	NC_016112	TATCGG	2	12	264350	264361	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	357403623
4018	NC_016112	GCC	2	6	264364	264369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403623
4019	NC_016112	CAC	2	6	264372	264377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357403623
4020	NC_016112	CGAG	2	8	264437	264444	25 %	0 %	50 %	25 %	357403623
4021	NC_016112	GAC	2	6	264519	264524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403623
4022	NC_016112	TGA	2	6	264551	264556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403623
4023	NC_016112	GGT	2	6	264632	264637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357403623
4024	NC_016112	CGT	2	6	264732	264737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403623
4025	NC_016112	GCGA	2	8	264781	264788	25 %	0 %	50 %	25 %	357403623
4026	NC_016112	T	8	8	264796	264803	0 %	100 %	0 %	0 %	357403623
4027	NC_016112	TTG	2	6	264807	264812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403623
4028	NC_016112	T	6	6	264867	264872	0 %	100 %	0 %	0 %	357403623
4029	NC_016112	TCC	2	6	264904	264909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357403623
4030	NC_016112	ATGC	2	8	264951	264958	25 %	25 %	25 %	25 %	357403623
4031	NC_016112	CGG	2	6	264962	264967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403623
4032	NC_016112	GCTG	2	8	265016	265023	0 %	25 %	50 %	25 %	357403623
4033	NC_016112	AAC	2	6	265298	265303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403624
4034	NC_016112	TCG	2	6	265304	265309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403624
4035	NC_016112	CAT	2	6	265339	265344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403624
4036	NC_016112	CTT	2	6	265359	265364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403624
4037	NC_016112	AAG	2	6	265370	265375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403624
4038	NC_016112	ACT	2	6	265411	265416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403624
4039	NC_016112	CTGC	2	8	265540	265547	0 %	25 %	25 %	50 %	357403624
4040	NC_016112	CAAT	2	8	265552	265559	50 %	25 %	0 %	25 %	357403624
4041	NC_016112	T	6	6	265617	265622	0 %	100 %	0 %	0 %	357403624
4042	NC_016112	T	8	8	265642	265649	0 %	100 %	0 %	0 %	357403624
4043	NC_016112	AAGA	2	8	265687	265694	75 %	0 %	25 %	0 %	357403624
4044	NC_016112	AAG	2	6	265712	265717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403624
4045	NC_016112	AGC	2	6	265771	265776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403624
4046	NC_016112	ATT	2	6	265787	265792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403624
4047	NC_016112	CAAT	2	8	265956	265963	50 %	25 %	0 %	25 %	357403624
4048	NC_016112	TCGG	2	8	266002	266009	0 %	25 %	50 %	25 %	357403624
4049	NC_016112	TTA	2	6	266094	266099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403624
4050	NC_016112	TCGA	2	8	266116	266123	25 %	25 %	25 %	25 %	357403624
4051	NC_016112	AAT	2	6	266168	266173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403625
4052	NC_016112	CTGG	2	8	266219	266226	0 %	25 %	50 %	25 %	357403625
4053	NC_016112	AGCG	2	8	266244	266251	25 %	0 %	50 %	25 %	357403625
4054	NC_016112	CGC	2	6	266437	266442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403625
4055	NC_016112	T	6	6	266504	266509	0 %	100 %	0 %	0 %	357403625
4056	NC_016112	CGA	2	6	266517	266522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403625
4057	NC_016112	TTG	2	6	266538	266543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403625
4058	NC_016112	TCAG	2	8	266575	266582	25 %	25 %	25 %	25 %	357403625
4059	NC_016112	GTC	2	6	266596	266601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403625
4060	NC_016112	GTCAC	2	10	266691	266700	20 %	20 %	20 %	40 %	357403625
4061	NC_016112	A	6	6	266751	266756	100 %	0 %	0 %	0 %	357403625
4062	NC_016112	TCA	2	6	266766	266771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403625
4063	NC_016112	GTT	2	6	267202	267207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403626
4064	NC_016112	GAT	2	6	267246	267251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403626
4065	NC_016112	TGT	2	6	267323	267328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403626
4066	NC_016112	GAT	2	6	267345	267350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403626
4067	NC_016112	TCG	2	6	267361	267366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403626
4068	NC_016112	GTT	2	6	267456	267461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403626
4069	NC_016112	ACG	2	6	267520	267525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403626
4070	NC_016112	CTGG	2	8	267528	267535	0 %	25 %	50 %	25 %	357403626
4071	NC_016112	CTT	2	6	267548	267553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403626
4072	NC_016112	ATG	2	6	267594	267599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403626
4073	NC_016112	GC	3	6	267647	267652	0 %	0 %	50 %	50 %	357403626
4074	NC_016112	TCG	2	6	267661	267666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403626
4075	NC_016112	CAA	2	6	267669	267674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403626
4076	NC_016112	ATGCG	2	10	267707	267716	20 %	20 %	40 %	20 %	357403626
4077	NC_016112	GCC	2	6	267726	267731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403626
4078	NC_016112	T	6	6	267928	267933	0 %	100 %	0 %	0 %	357403626
4079	NC_016112	GAT	2	6	268002	268007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403626
4080	NC_016112	GTA	2	6	268010	268015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403626
4081	NC_016112	GGT	2	6	268017	268022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357403626
4082	NC_016112	GCC	2	6	268436	268441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403627
4083	NC_016112	ACC	2	6	268471	268476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357403627
4084	NC_016112	CAG	2	6	268488	268493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403627
4085	NC_016112	CGA	2	6	268514	268519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403627
4086	NC_016112	ACC	2	6	268591	268596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357403627
4087	NC_016112	AGT	2	6	268636	268641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403627
4088	NC_016112	CAG	2	6	268650	268655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403627
4089	NC_016112	A	7	7	268686	268692	100 %	0 %	0 %	0 %	357403627
4090	NC_016112	CTT	2	6	268727	268732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403627
4091	NC_016112	CGA	2	6	268778	268783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403627
4092	NC_016112	ATG	2	6	268813	268818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403627
4093	NC_016112	AGCC	2	8	268870	268877	25 %	0 %	25 %	50 %	357403627
4094	NC_016112	CGC	2	6	268998	269003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403627
4095	NC_016112	A	6	6	269014	269019	100 %	0 %	0 %	0 %	357403627
4096	NC_016112	GTT	2	6	269020	269025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403627
4097	NC_016112	GCG	2	6	269041	269046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403627
4098	NC_016112	TC	3	6	269284	269289	0 %	50 %	0 %	50 %	357403627
4099	NC_016112	GCG	3	9	269303	269311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403627
4100	NC_016112	CCA	2	6	269315	269320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357403627
4101	NC_016112	TAA	2	6	269339	269344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403628
4102	NC_016112	TGA	2	6	269419	269424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403628
4103	NC_016112	CAG	2	6	269426	269431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403628
4104	NC_016112	CG	4	8	269500	269507	0 %	0 %	50 %	50 %	357403628
4105	NC_016112	TCC	2	6	269607	269612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357403628
4106	NC_016112	GCA	2	6	269632	269637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403628
4107	NC_016112	CGC	2	6	269774	269779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403628
4108	NC_016112	CGG	2	6	269797	269802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403628
4109	NC_016112	GATC	2	8	269821	269828	25 %	25 %	25 %	25 %	357403628
4110	NC_016112	T	6	6	269843	269848	0 %	100 %	0 %	0 %	357403628
4111	NC_016112	GAT	2	6	269882	269887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403628
4112	NC_016112	GCG	2	6	269901	269906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403628
4113	NC_016112	ATA	2	6	270096	270101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403628
4114	NC_016112	GCC	2	6	270701	270706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403629
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4116	NC_016112	TAA	2	6	270831	270836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403629
4117	NC_016112	GCC	2	6	270843	270848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403629
4118	NC_016112	CGG	2	6	270968	270973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403629
4119	NC_016112	ACG	2	6	270975	270980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403629
4120	NC_016112	GCG	2	6	271058	271063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403629
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4122	NC_016112	CG	4	8	271087	271094	0 %	0 %	50 %	50 %	357403629
4123	NC_016112	TTG	2	6	271128	271133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403629
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4229	NC_016112	TCT	2	6	277216	277221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403634
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4231	NC_016112	GAC	2	6	277284	277289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403634
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4235	NC_016112	GC	3	6	277426	277431	0 %	0 %	50 %	50 %	357403634
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4240	NC_016112	T	6	6	277637	277642	0 %	100 %	0 %	0 %	357403634
4241	NC_016112	CCA	2	6	277644	277649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357403634
4242	NC_016112	GTT	2	6	277712	277717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403634
4243	NC_016112	CGG	2	6	277724	277729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403634
4244	NC_016112	TGA	2	6	277742	277747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403634
4245	NC_016112	CCGCG	2	10	277754	277763	0 %	0 %	40 %	60 %	357403634
4246	NC_016112	CAG	2	6	277821	277826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403634
4247	NC_016112	GAGCG	2	10	277836	277845	20 %	0 %	60 %	20 %	357403634
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4253	NC_016112	TCG	2	6	278035	278040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403634
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4332	NC_016112	A	7	7	282845	282851	100 %	0 %	0 %	0 %	357403639
4333	NC_016112	GTCGG	2	10	282864	282873	0 %	20 %	60 %	20 %	357403639
4334	NC_016112	CGGT	2	8	282897	282904	0 %	25 %	50 %	25 %	357403639
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4336	NC_016112	AT	3	6	282928	282933	50 %	50 %	0 %	0 %	357403639
4337	NC_016112	CAGG	2	8	282937	282944	25 %	0 %	50 %	25 %	357403639
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4354	NC_016112	GGC	3	9	283669	283677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403640
4355	NC_016112	CGA	2	6	283721	283726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403640
4356	NC_016112	TCG	2	6	283739	283744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403640
4357	NC_016112	GCAAT	2	10	283807	283816	40 %	20 %	20 %	20 %	357403640
4358	NC_016112	GCA	2	6	283931	283936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403640
4359	NC_016112	TCGA	2	8	283993	284000	25 %	25 %	25 %	25 %	357403640
4360	NC_016112	GCG	2	6	284008	284013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403640
4361	NC_016112	GAT	2	6	284019	284024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403640
4362	NC_016112	GGTT	2	8	284032	284039	0 %	50 %	50 %	0 %	357403640
4363	NC_016112	ATT	2	6	284126	284131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403640
4364	NC_016112	TGA	2	6	284132	284137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403640
4365	NC_016112	TAA	2	6	284139	284144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403640
4366	NC_016112	CGG	2	6	284154	284159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403640
4367	NC_016112	TGACCG	2	12	284217	284228	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	357403641
4368	NC_016112	CGAT	2	8	284238	284245	25 %	25 %	25 %	25 %	357403641
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4370	NC_016112	GCC	2	6	284553	284558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403641
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4375	NC_016112	CAA	2	6	284762	284767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403641
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4377	NC_016112	GCC	2	6	284891	284896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403641
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4381	NC_016112	GCCGG	2	10	285076	285085	0 %	0 %	60 %	40 %	357403641
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4383	NC_016112	TCTG	2	8	285146	285153	0 %	50 %	25 %	25 %	357403641
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4386	NC_016112	GCT	2	6	285364	285369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403642
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4402	NC_016112	A	6	6	286470	286475	100 %	0 %	0 %	0 %	357403642
4403	NC_016112	TCG	2	6	286888	286893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403643
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4421	NC_016112	A	8	8	288105	288112	100 %	0 %	0 %	0 %	357403643
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4423	NC_016112	GGCGC	2	10	288501	288510	0 %	0 %	60 %	40 %	357403644
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4429	NC_016112	T	6	6	288711	288716	0 %	100 %	0 %	0 %	357403644
4430	NC_016112	TGT	2	6	288790	288795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403644
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4433	NC_016112	CGG	2	6	288923	288928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403645
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4438	NC_016112	GCCC	2	8	289081	289088	0 %	0 %	25 %	75 %	357403645
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4442	NC_016112	TTC	2	6	289302	289307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403645
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4456	NC_016112	CG	3	6	289854	289859	0 %	0 %	50 %	50 %	357403645
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4469	NC_016112	TGAA	2	8	290269	290276	50 %	25 %	25 %	0 %	357403645
4470	NC_016112	CCA	2	6	290343	290348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357403646
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4477	NC_016112	CGCGG	2	10	291340	291349	0 %	0 %	60 %	40 %	357403647
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4480	NC_016112	GCA	2	6	291660	291665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403647
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4482	NC_016112	CCG	3	9	291746	291754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403647
4483	NC_016112	AGA	2	6	291777	291782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403647
4484	NC_016112	CGA	2	6	291861	291866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403647
4485	NC_016112	A	6	6	291878	291883	100 %	0 %	0 %	0 %	357403647
4486	NC_016112	GCG	2	6	292002	292007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403647
4487	NC_016112	TTG	2	6	292031	292036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403647
4488	NC_016112	CCG	2	6	292046	292051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403647
4489	NC_016112	CCG	2	6	292194	292199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403647
4490	NC_016112	CG	3	6	292208	292213	0 %	0 %	50 %	50 %	357403647
4491	NC_016112	ACG	2	6	292278	292283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403647
4492	NC_016112	GGCAA	2	10	292316	292325	40 %	0 %	40 %	20 %	357403647
4493	NC_016112	CTG	2	6	292397	292402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403647
4494	NC_016112	TTG	2	6	292406	292411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403647
4495	NC_016112	AGG	2	6	292491	292496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357403647
4496	NC_016112	GGCG	2	8	292528	292535	0 %	0 %	75 %	25 %	357403648
4497	NC_016112	CCCG	2	8	292596	292603	0 %	0 %	25 %	75 %	357403648
4498	NC_016112	GGC	2	6	292621	292626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403648
4499	NC_016112	TCA	2	6	292788	292793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403649
4500	NC_016112	TGA	2	6	292818	292823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403649

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